Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC51Q96ER9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC51Q96ER9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC51Q96ER9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC51Q96ER9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC51Q96ER9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC51Q96ER9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC51Q96ER9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC51Q96ER9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms