Protein–RNA interactions for Protein: Q96A65

EXOC4, Exocyst complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC4Q96A65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOC4Q96A65 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOC4Q96A65 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOC4Q96A65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOC4Q96A65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOC4Q96A65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOC4Q96A65 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOC4Q96A65 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EXOC4Q96A65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOC4Q96A65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EXOC4Q96A65 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms