Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A4Q969I6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A4Q969I6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC38A4Q969I6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A4Q969I6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A4Q969I6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A4Q969I6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms