Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP7Q93009 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP7Q93009 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP7Q93009 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP7Q93009 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP7Q93009 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP7Q93009 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP7Q93009 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP7Q93009 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP7Q93009 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP7Q93009 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP7Q93009 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP7Q93009 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP7Q93009 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP7Q93009 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP7Q93009 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP7Q93009 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP7Q93009 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP7Q93009 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP7Q93009 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP7Q93009 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP7Q93009 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP7Q93009 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP7Q93009 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP7Q93009 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP7Q93009 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP7Q93009 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP7Q93009 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP7Q93009 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP7Q93009 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP7Q93009 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP7Q93009 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP7Q93009 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP7Q93009 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP7Q93009 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP7Q93009 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP7Q93009 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP7Q93009 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP7Q93009 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP7Q93009 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP7Q93009 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP7Q93009 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP7Q93009 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP7Q93009 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP7Q93009 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP7Q93009 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP7Q93009 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP7Q93009 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP7Q93009 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP7Q93009 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP7Q93009 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP7Q93009 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP7Q93009 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP7Q93009 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP7Q93009 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP7Q93009 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP7Q93009 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP7Q93009 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP7Q93009 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP7Q93009 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP7Q93009 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP7Q93009 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP7Q93009 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP7Q93009 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP7Q93009 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP7Q93009 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP7Q93009 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP7Q93009 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP7Q93009 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP7Q93009 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP7Q93009 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP7Q93009 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP7Q93009 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP7Q93009 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP7Q93009 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP7Q93009 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP7Q93009 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP7Q93009 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP7Q93009 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP7Q93009 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP7Q93009 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP7Q93009 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP7Q93009 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP7Q93009 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP7Q93009 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP7Q93009 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP7Q93009 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP7Q93009 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP7Q93009 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP7Q93009 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP7Q93009 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP7Q93009 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP7Q93009 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP7Q93009 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP7Q93009 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP7Q93009 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP7Q93009 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP7Q93009 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP7Q93009 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP7Q93009 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms