Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX1Q92786 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROX1Q92786 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROX1Q92786 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX1Q92786 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX1Q92786 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PROX1Q92786 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROX1Q92786 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms