Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR4A3Q92570 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR4A3Q92570 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR4A3Q92570 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR4A3Q92570 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR4A3Q92570 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms