Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HDAC7Q8WUI4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HDAC7Q8WUI4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC7Q8WUI4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HDAC7Q8WUI4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC7Q8WUI4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HDAC7Q8WUI4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HDAC7Q8WUI4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC7Q8WUI4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HDAC7Q8WUI4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDAC7Q8WUI4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDAC7Q8WUI4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC7Q8WUI4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms