Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBF2

FAM213B, Prostamide/prostaglandin F synthase, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM213BQ8TBF2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM213BQ8TBF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM213BQ8TBF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM213BQ8TBF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM213BQ8TBF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM213BQ8TBF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM213BQ8TBF2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms