Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GADD45GIP1Q8TAE8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GADD45GIP1Q8TAE8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GADD45GIP1Q8TAE8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GADD45GIP1Q8TAE8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GADD45GIP1Q8TAE8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GADD45GIP1Q8TAE8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GADD45GIP1Q8TAE8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GADD45GIP1Q8TAE8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GADD45GIP1Q8TAE8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GADD45GIP1Q8TAE8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GADD45GIP1Q8TAE8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GADD45GIP1Q8TAE8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GADD45GIP1Q8TAE8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GADD45GIP1Q8TAE8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms