Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP61Q8NHU2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP61Q8NHU2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP61Q8NHU2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP61Q8NHU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP61Q8NHU2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP61Q8NHU2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP61Q8NHU2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP61Q8NHU2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms