Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST4Q8NCG5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST4Q8NCG5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHST4Q8NCG5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST4Q8NCG5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST4Q8NCG5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST4Q8NCG5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST4Q8NCG5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms