Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NINQ8N4C6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NINQ8N4C6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NINQ8N4C6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NINQ8N4C6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms