Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD2

KLHDC8A, Kelch domain-containing protein 8A, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8AQ8IYD2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHDC8AQ8IYD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC8AQ8IYD2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC8AQ8IYD2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHDC8AQ8IYD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHDC8AQ8IYD2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms