Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC103Q8IW40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC103Q8IW40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC103Q8IW40 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC103Q8IW40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC103Q8IW40 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC103Q8IW40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC103Q8IW40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms