Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPRSS6Q8IU80 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMPRSS6Q8IU80 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMPRSS6Q8IU80 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPRSS6Q8IU80 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPRSS6Q8IU80 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMPRSS6Q8IU80 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms