Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDSS2Q86YH6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDSS2Q86YH6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDSS2Q86YH6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDSS2Q86YH6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDSS2Q86YH6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDSS2Q86YH6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDSS2Q86YH6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDSS2Q86YH6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDSS2Q86YH6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDSS2Q86YH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDSS2Q86YH6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDSS2Q86YH6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDSS2Q86YH6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms