Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG1Q86XK7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSIG1Q86XK7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSIG1Q86XK7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG1Q86XK7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG1Q86XK7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms