Protein–RNA interactions for Protein: Q86VY9

TMEM200A, Transmembrane protein 200A, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200AQ86VY9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM200AQ86VY9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM200AQ86VY9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM200AQ86VY9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM200AQ86VY9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM200AQ86VY9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM200AQ86VY9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms