Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NPM2Q86SE8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NPM2Q86SE8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NPM2Q86SE8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NPM2Q86SE8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NPM2Q86SE8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NPM2Q86SE8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NPM2Q86SE8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NPM2Q86SE8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms