Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z794

KRT77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT77Q7Z794 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT77Q7Z794 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT77Q7Z794 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT77Q7Z794 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT77Q7Z794 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT77Q7Z794 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT77Q7Z794 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT77Q7Z794 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT77Q7Z794 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT77Q7Z794 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT77Q7Z794 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT77Q7Z794 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms