Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN04

MEX3B, RNA-binding protein MEX3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3BQ6ZN04 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MEX3BQ6ZN04 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEX3BQ6ZN04 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEX3BQ6ZN04 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEX3BQ6ZN04 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEX3BQ6ZN04 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEX3BQ6ZN04 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms