Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRAIDQ6UW56 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATRAIDQ6UW56 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRAIDQ6UW56 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRAIDQ6UW56 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRAIDQ6UW56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRAIDQ6UW56 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRAIDQ6UW56 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms