Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPN5Q6U736 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OPN5Q6U736 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPN5Q6U736 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OPN5Q6U736 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OPN5Q6U736 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPN5Q6U736 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms