Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RHBDF2Q6PJF5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHBDF2Q6PJF5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHBDF2Q6PJF5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RHBDF2Q6PJF5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDF2Q6PJF5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms