Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AAGABQ6PD74 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AAGABQ6PD74 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AAGABQ6PD74 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AAGABQ6PD74 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AAGABQ6PD74 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms