Protein–RNA interactions for Protein: Q64LD2

WDR25, WD repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR25Q64LD2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR25Q64LD2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
WDR25Q64LD2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR25Q64LD2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR25Q64LD2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR25Q64LD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms