Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP78Q5JTW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEP78Q5JTW2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEP78Q5JTW2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP78Q5JTW2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP78Q5JTW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP78Q5JTW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP78Q5JTW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP78Q5JTW2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP78Q5JTW2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP78Q5JTW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP78Q5JTW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP78Q5JTW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP78Q5JTW2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms