Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRTAP27-1Q3LI81 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRTAP27-1Q3LI81 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRTAP27-1Q3LI81 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTAP27-1Q3LI81 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms