Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC6LQ2NKX8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6LQ2NKX8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERCC6LQ2NKX8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6LQ2NKX8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC6LQ2NKX8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC6LQ2NKX8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC6LQ2NKX8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC6LQ2NKX8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms