Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.622e-24■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 29.68□□□□□ -0.861e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 47.9□□□□□ -1.141e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 35.76□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 34.86□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 28.4
SRSF7Q16629 SLC43A1-202ENST00000524995 953 ntTSL 315.69■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-207ENST00000533066 999 ntTSL 314.06□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 514.05□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-206ENST00000530159 788 ntTSL 513.15□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 SLC43A1-203ENST00000525764 556 ntTSL 310.47□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 28.2
SRSF7Q16629 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 28
SRSF7Q16629 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 28
SRSF7Q16629 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 28
SRSF7Q16629 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 28
SRSF7Q16629 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 RERE-216ENST00000505225 533 ntTSL 25.3□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 GPBP1L1-206ENST00000479235 3121 ntTSL 24.78□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 GPBP1L1-205ENST00000468724 559 ntTSL 34.15□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 28
SRSF7Q16629 LINC01033-201ENST00000504609 735 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.661e-8■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.39e-13■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.329e-13■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 29.77□□□□□ -0.849e-13■■■■■ 27.9
SRSF7Q16629 LRP3-202ENST00000590275 1078 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.073e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 LRP3-204ENST00000592484 575 ntTSL 412.16□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.823e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.853e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.953e-16■■■■■ 27.7
SRSF7Q16629 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 27.5
SRSF7Q16629 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 27.5
SRSF7Q16629 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 39.24□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 27.5
SRSF7Q16629 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 27.5
SRSF7Q16629 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 27.4
SRSF7Q16629 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 27.4
SRSF7Q16629 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.639e-9■■■■■ 27.3
SRSF7Q16629 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.1
SRSF7Q16629 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 27.1
SRSF7Q16629 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 27.1
SRSF7Q16629 ARHGEF16-205ENST00000445297 836 ntTSL 318.92■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 PTPN4-208ENST00000460289 577 ntTSL 418.1■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 PTPN4-207ENST00000460162 623 ntTSL 417.53■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 PTPN4-211ENST00000488279 662 ntTSL 517.41■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 PTPN4-202ENST00000420482 568 ntTSL 416.51■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 510.6□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 PTPN4-210ENST00000485247 590 ntTSL 34.16□□□□□ -1.742e-8■■■■■ 27
SRSF7Q16629 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-209ENST00000448962 2384 ntTSL 213.17□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-210ENST00000460761 644 ntTSL 211.33□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 210.87□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-208ENST00000445961 944 ntTSL 510.86□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-212ENST00000495002 956 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 210.42□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 515.88■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 513.49□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 56.67□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 26.21□□□□□ -1.425e-7■■■■■ 26.9
SRSF7Q16629 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 26.9
Retrieved 100 of 5,030 protein–RNA pairs in 168.9 ms