RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445297.5

ARHGEF16-205, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 16, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF16, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF16-205ENST00000445297 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.91■■■■■ 6.54
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ARHGEF16-205ENST00000445297 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.51■■■■■ 5.68
ARHGEF16-205ENST00000445297 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.48■■■■■ 5.35
ARHGEF16-205ENST00000445297 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.42■■■■■ 5.34
ARHGEF16-205ENST00000445297 NACADO15069 1562 aa47.88■■■■■ 5.26
ARHGEF16-205ENST00000445297 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.52■■■■■ 5.2
ARHGEF16-205ENST00000445297 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.5■■■■■ 5.19
ARHGEF16-205ENST00000445297 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.27■■■■■ 5.16
ARHGEF16-205ENST00000445297 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.97■■■■■ 5.11
ARHGEF16-205ENST00000445297 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.95■■■■■ 5.11
ARHGEF16-205ENST00000445297 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.31■■■■■ 5
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ARHGEF16-205ENST00000445297 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.18■■■■■ 4.98
ARHGEF16-205ENST00000445297 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.17■■■■■ 4.98
ARHGEF16-205ENST00000445297 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.12■■■■■ 4.97
ARHGEF16-205ENST00000445297 SCRIBQ14160 1630 aa46.03■■■■■ 4.96
ARHGEF16-205ENST00000445297 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
ARHGEF16-205ENST00000445297 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.03■■■■■ 4.8
ARHGEF16-205ENST00000445297 CUX2O14529 1486 aa44.38■■■■■ 4.69
ARHGEF16-205ENST00000445297 ERCC6Q03468 1493 aa44.29■■■■■ 4.68
ARHGEF16-205ENST00000445297 NCAPD3P42695 1498 aa44.17■■■■■ 4.66
ARHGEF16-205ENST00000445297 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.97■■■■■ 4.63
ARHGEF16-205ENST00000445297 SMARCA2P51531 1590 aa43.85■■■■■ 4.61
ARHGEF16-205ENST00000445297 HMGXB3Q12766 1538 aa43.84■■■■■ 4.61
ARHGEF16-205ENST00000445297 SMARCA4P51532 1647 aa43.8■■■■■ 4.6
ARHGEF16-205ENST00000445297 NESP48681 1621 aa43.75■■■■■ 4.59
ARHGEF16-205ENST00000445297 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
ARHGEF16-205ENST00000445297 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
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ARHGEF16-205ENST00000445297 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.34■■■■■ 4.53
ARHGEF16-205ENST00000445297 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.33■■■■■ 4.53
ARHGEF16-205ENST00000445297 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.19■■■■■ 4.5
ARHGEF16-205ENST00000445297 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.12■■■■■ 4.49
ARHGEF16-205ENST00000445297 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.08■■■■■ 4.49
ARHGEF16-205ENST00000445297 TRIM41Q8WV44 630 aa42.9■■■■■ 4.46
ARHGEF16-205ENST00000445297 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.81■■■■■ 4.44
ARHGEF16-205ENST00000445297 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.81■■■■■ 4.44
ARHGEF16-205ENST00000445297 WDR62O43379 1518 aa42.71■■■■■ 4.43
ARHGEF16-205ENST00000445297 WIZO95785 1651 aa42.55■■■■■ 4.4
ARHGEF16-205ENST00000445297 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.52■■■■■ 4.4
ARHGEF16-205ENST00000445297 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
ARHGEF16-205ENST00000445297 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.39■■■■■ 4.38
ARHGEF16-205ENST00000445297 CFTRP13569 1480 aa42.19■■■■■ 4.34
ARHGEF16-205ENST00000445297 OSCARQ8IYS5 282 aa42.18■■■■■ 4.34
ARHGEF16-205ENST00000445297 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
ARHGEF16-205ENST00000445297 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
ARHGEF16-205ENST00000445297 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.77■■■■■ 4.28
ARHGEF16-205ENST00000445297 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.77■■■■■ 4.28
ARHGEF16-205ENST00000445297 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.77■■■■■ 4.28
ARHGEF16-205ENST00000445297 PRDM2Q13029 1718 aa41.77■■■■■ 4.28
ARHGEF16-205ENST00000445297 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
ARHGEF16-205ENST00000445297 IFT140Q96RY7 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
ARHGEF16-205ENST00000445297 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
ARHGEF16-205ENST00000445297 ARHGEF11O15085 1522 aa41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF16-205ENST00000445297 TOPBP1Q92547 1522 aa41.49■■■■■ 4.23
ARHGEF16-205ENST00000445297 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.47■■■■■ 4.23
ARHGEF16-205ENST00000445297 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
ARHGEF16-205ENST00000445297 ABCC8Q09428 1581 aa41.33■■■■■ 4.21
ARHGEF16-205ENST00000445297 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.3■■■■■ 4.2
ARHGEF16-205ENST00000445297 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.27■■■■■ 4.2
ARHGEF16-205ENST00000445297 CHD1O14646 1710 aa41.25■■■■■ 4.19
ARHGEF16-205ENST00000445297 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.187e-7■■■□□ 17.5
ARHGEF16-205ENST00000445297 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
ARHGEF16-205ENST00000445297 ARAP1Q96P48 1450 aa41.12■■■■■ 4.17
ARHGEF16-205ENST00000445297 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
ARHGEF16-205ENST00000445297 FBLN2P98095 1184 aa41.09■■■■■ 4.17
ARHGEF16-205ENST00000445297 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
ARHGEF16-205ENST00000445297 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.89■■■■■ 4.14
ARHGEF16-205ENST00000445297 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
ARHGEF16-205ENST00000445297 SOGA1O94964 1423 aa40.82■■■■■ 4.12
ARHGEF16-205ENST00000445297 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.8■■■■■ 4.12
ARHGEF16-205ENST00000445297 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.73■■■■■ 4.11
ARHGEF16-205ENST00000445297 WDR97A6NE52 1622 aa40.72■■■■■ 4.11
ARHGEF16-205ENST00000445297 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.7■■■■■ 4.11
ARHGEF16-205ENST00000445297 SYNJ1O43426 1573 aa40.69■■■■■ 4.1
ARHGEF16-205ENST00000445297 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
ARHGEF16-205ENST00000445297 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF16-205ENST00000445297 GRIN2BQ13224 1484 aa40.57■■■■■ 4.08
ARHGEF16-205ENST00000445297 CUX1P39880 1505 aa40.53■■■■■ 4.08
ARHGEF16-205ENST00000445297 SYNJ2O15056 1496 aa40.51■■■■■ 4.07
ARHGEF16-205ENST00000445297 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
ARHGEF16-205ENST00000445297 PBRM1Q86U86 1689 aa40.39■■■■■ 4.06
ARHGEF16-205ENST00000445297 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF16-205ENST00000445297 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.2■■■■■ 4.03
ARHGEF16-205ENST00000445297 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.16■■■■■ 4.02
ARHGEF16-205ENST00000445297 GRIN2AQ12879 1464 aa40.05■■■■■ 4
ARHGEF16-205ENST00000445297 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.05■■■■■ 4
ARHGEF16-205ENST00000445297 ADAMTS12P58397 1594 aa39.97■■■■□ 3.99
ARHGEF16-205ENST00000445297 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
ARHGEF16-205ENST00000445297 CEP170Q5SW79 1584 aa39.95■■■■□ 3.99
ARHGEF16-205ENST00000445297 NUP160Q12769 1436 aa39.91■■■■□ 3.98
ARHGEF16-205ENST00000445297 SHROOM2Q13796 1616 aa39.81■■■■□ 3.96
ARHGEF16-205ENST00000445297 TOP2BQ02880 1626 aa39.8■■■■□ 3.96
ARHGEF16-205ENST00000445297 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.78■■■■□ 3.96
ARHGEF16-205ENST00000445297 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.77■■■■□ 3.96
ARHGEF16-205ENST00000445297 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.66■■■■□ 3.94
ARHGEF16-205ENST00000445297 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.65■■■■□ 3.94
ARHGEF16-205ENST00000445297 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
ARHGEF16-205ENST00000445297 JPH4Q96JJ6 628 aa39.46■■■■□ 3.91
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