Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A3R2Q15599 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A3R2Q15599 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A3R2Q15599 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC9A3R2Q15599 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A3R2Q15599 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A3R2Q15599 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A3R2Q15599 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms