Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN7L3Q14CW9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN7L3Q14CW9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN7L3Q14CW9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN7L3Q14CW9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN7L3Q14CW9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN7L3Q14CW9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN7L3Q14CW9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN7L3Q14CW9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATXN7L3Q14CW9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN7L3Q14CW9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN7L3Q14CW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3Q14CW9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms