Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDE3BQ13370 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDE3BQ13370 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PDE3BQ13370 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PDE3BQ13370 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PDE3BQ13370 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PDE3BQ13370 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PDE3BQ13370 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDE3BQ13370 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDE3BQ13370 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDE3BQ13370 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDE3BQ13370 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDE3BQ13370 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDE3BQ13370 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PDE3BQ13370 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
PDE3BQ13370 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PDE3BQ13370 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PDE3BQ13370 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDE3BQ13370 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PDE3BQ13370 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDE3BQ13370 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDE3BQ13370 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDE3BQ13370 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDE3BQ13370 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDE3BQ13370 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PDE3BQ13370 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
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