Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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