Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCK1Q08629 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOCK1Q08629 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPOCK1Q08629 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPOCK1Q08629 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCK1Q08629 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms