Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNK2Q07912 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNK2Q07912 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNK2Q07912 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNK2Q07912 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNK2Q07912 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNK2Q07912 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNK2Q07912 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNK2Q07912 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNK2Q07912 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNK2Q07912 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNK2Q07912 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNK2Q07912 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNK2Q07912 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TNK2Q07912 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNK2Q07912 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNK2Q07912 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TNK2Q07912 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TNK2Q07912 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNK2Q07912 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TNK2Q07912 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNK2Q07912 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms