Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP27A1Q02318 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP27A1Q02318 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP27A1Q02318 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP27A1Q02318 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP27A1Q02318 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP27A1Q02318 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP27A1Q02318 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms