Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX6-1P78426 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX6-1P78426 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX6-1P78426 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX6-1P78426 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX6-1P78426 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX6-1P78426 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms