Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IRX5P78411 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
IRX5P78411 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX5P78411 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX5P78411 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX5P78411 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX5P78411 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX5P78411 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX5P78411 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX5P78411 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX5P78411 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX5P78411 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX5P78411 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX5P78411 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX5P78411 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX5P78411 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRX5P78411 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX5P78411 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX5P78411 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX5P78411 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX5P78411 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX5P78411 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX5P78411 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX5P78411 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX5P78411 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX5P78411 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX5P78411 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX5P78411 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX5P78411 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX5P78411 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX5P78411 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
IRX5P78411 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IRX5P78411 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IRX5P78411 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX5P78411 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX5P78411 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX5P78411 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX5P78411 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX5P78411 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX5P78411 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX5P78411 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX5P78411 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX5P78411 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRX5P78411 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRX5P78411 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX5P78411 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX5P78411 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX5P78411 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX5P78411 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX5P78411 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX5P78411 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX5P78411 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX5P78411 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX5P78411 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX5P78411 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX5P78411 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX5P78411 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX5P78411 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX5P78411 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX5P78411 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX5P78411 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX5P78411 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX5P78411 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX5P78411 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX5P78411 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX5P78411 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX5P78411 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX5P78411 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX5P78411 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX5P78411 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
IRX5P78411 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX5P78411 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX5P78411 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX5P78411 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX5P78411 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IRX5P78411 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX5P78411 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX5P78411 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX5P78411 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX5P78411 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX5P78411 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX5P78411 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX5P78411 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX5P78411 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX5P78411 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX5P78411 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX5P78411 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX5P78411 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX5P78411 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX5P78411 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX5P78411 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX5P78411 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX5P78411 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX5P78411 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX5P78411 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX5P78411 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX5P78411 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX5P78411 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX5P78411 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX5P78411 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms