Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRPAP78324 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIRPAP78324 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRPAP78324 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIRPAP78324 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIRPAP78324 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRPAP78324 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms