Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARPC4P59998 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARPC4P59998 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4P59998 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARPC4P59998 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARPC4P59998 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms