Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHMP4BP1P59074 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHMP4BP1P59074 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHMP4BP1P59074 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHMP4BP1P59074 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHMP4BP1P59074 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CHMP4BP1P59074 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms