Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC16A1P53985 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A1P53985 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC16A1P53985 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC16A1P53985 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC16A1P53985 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC16A1P53985 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms