Protein–RNA interactions for Protein: P49796

RGS3, Regulator of G-protein signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS3P49796 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGS3P49796 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGS3P49796 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGS3P49796 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGS3P49796 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGS3P49796 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGS3P49796 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGS3P49796 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGS3P49796 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RGS3P49796 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RGS3P49796 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGS3P49796 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGS3P49796 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGS3P49796 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGS3P49796 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGS3P49796 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGS3P49796 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGS3P49796 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGS3P49796 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGS3P49796 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGS3P49796 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGS3P49796 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RGS3P49796 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGS3P49796 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGS3P49796 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RGS3P49796 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RGS3P49796 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RGS3P49796 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGS3P49796 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
RGS3P49796 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGS3P49796 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGS3P49796 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGS3P49796 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGS3P49796 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGS3P49796 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGS3P49796 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGS3P49796 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGS3P49796 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
RGS3P49796 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGS3P49796 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGS3P49796 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGS3P49796 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGS3P49796 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGS3P49796 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGS3P49796 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGS3P49796 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGS3P49796 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGS3P49796 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RGS3P49796 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGS3P49796 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGS3P49796 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGS3P49796 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RGS3P49796 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGS3P49796 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGS3P49796 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGS3P49796 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGS3P49796 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGS3P49796 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGS3P49796 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGS3P49796 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGS3P49796 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGS3P49796 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGS3P49796 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGS3P49796 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGS3P49796 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGS3P49796 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGS3P49796 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGS3P49796 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGS3P49796 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGS3P49796 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGS3P49796 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGS3P49796 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RGS3P49796 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RGS3P49796 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGS3P49796 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RGS3P49796 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGS3P49796 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RGS3P49796 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RGS3P49796 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RGS3P49796 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RGS3P49796 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RGS3P49796 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RGS3P49796 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RGS3P49796 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RGS3P49796 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RGS3P49796 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RGS3P49796 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RGS3P49796 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RGS3P49796 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGS3P49796 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGS3P49796 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGS3P49796 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGS3P49796 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RGS3P49796 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RGS3P49796 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGS3P49796 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGS3P49796 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGS3P49796 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RGS3P49796 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RGS3P49796 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms