Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPIAP49247 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPIAP49247 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPIAP49247 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPIAP49247 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPIAP49247 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPIAP49247 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPIAP49247 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPIAP49247 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPIAP49247 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPIAP49247 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPIAP49247 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RPIAP49247 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPIAP49247 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPIAP49247 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPIAP49247 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPIAP49247 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPIAP49247 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPIAP49247 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPIAP49247 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPIAP49247 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPIAP49247 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPIAP49247 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPIAP49247 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPIAP49247 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPIAP49247 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPIAP49247 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPIAP49247 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPIAP49247 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPIAP49247 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPIAP49247 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPIAP49247 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPIAP49247 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPIAP49247 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPIAP49247 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPIAP49247 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPIAP49247 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPIAP49247 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPIAP49247 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPIAP49247 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPIAP49247 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPIAP49247 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPIAP49247 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPIAP49247 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPIAP49247 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPIAP49247 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPIAP49247 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPIAP49247 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPIAP49247 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPIAP49247 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPIAP49247 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPIAP49247 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPIAP49247 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPIAP49247 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPIAP49247 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPIAP49247 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPIAP49247 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPIAP49247 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPIAP49247 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RPIAP49247 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPIAP49247 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPIAP49247 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPIAP49247 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPIAP49247 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPIAP49247 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPIAP49247 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPIAP49247 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPIAP49247 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPIAP49247 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPIAP49247 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPIAP49247 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPIAP49247 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPIAP49247 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPIAP49247 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPIAP49247 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPIAP49247 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPIAP49247 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPIAP49247 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPIAP49247 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPIAP49247 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPIAP49247 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPIAP49247 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RPIAP49247 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPIAP49247 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPIAP49247 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPIAP49247 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPIAP49247 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPIAP49247 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPIAP49247 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPIAP49247 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPIAP49247 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPIAP49247 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPIAP49247 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPIAP49247 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPIAP49247 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPIAP49247 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPIAP49247 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPIAP49247 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPIAP49247 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPIAP49247 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms