Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRGP48443 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RXRGP48443 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRGP48443 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRGP48443 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRGP48443 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RXRGP48443 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRGP48443 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRGP48443 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RXRGP48443 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RXRGP48443 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RXRGP48443 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RXRGP48443 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RXRGP48443 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RXRGP48443 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRGP48443 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRGP48443 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RXRGP48443 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RXRGP48443 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRGP48443 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRGP48443 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RXRGP48443 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RXRGP48443 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RXRGP48443 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RXRGP48443 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRGP48443 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRGP48443 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRGP48443 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RXRGP48443 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RXRGP48443 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RXRGP48443 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RXRGP48443 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRGP48443 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RXRGP48443 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRGP48443 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRGP48443 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RXRGP48443 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRGP48443 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRGP48443 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRGP48443 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRGP48443 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RXRGP48443 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRGP48443 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRGP48443 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRGP48443 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RXRGP48443 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RXRGP48443 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RXRGP48443 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RXRGP48443 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RXRGP48443 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RXRGP48443 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRGP48443 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRGP48443 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RXRGP48443 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRGP48443 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRGP48443 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRGP48443 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRGP48443 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RXRGP48443 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRGP48443 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRGP48443 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRGP48443 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRGP48443 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RXRGP48443 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRGP48443 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRGP48443 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRGP48443 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRGP48443 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RXRGP48443 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRGP48443 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRGP48443 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RXRGP48443 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRGP48443 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RXRGP48443 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRGP48443 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RXRGP48443 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRGP48443 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RXRGP48443 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRGP48443 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RXRGP48443 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RXRGP48443 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRGP48443 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRGP48443 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RXRGP48443 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRGP48443 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRGP48443 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRGP48443 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RXRGP48443 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRGP48443 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RXRGP48443 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRGP48443 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRGP48443 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRGP48443 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RXRGP48443 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RXRGP48443 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RXRGP48443 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRGP48443 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RXRGP48443 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRGP48443 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RXRGP48443 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms