Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT20P35900 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT20P35900 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT20P35900 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT20P35900 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT20P35900 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT20P35900 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT20P35900 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT20P35900 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT20P35900 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT20P35900 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT20P35900 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT20P35900 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT20P35900 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT20P35900 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT20P35900 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT20P35900 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT20P35900 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT20P35900 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT20P35900 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT20P35900 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT20P35900 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT20P35900 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT20P35900 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT20P35900 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT20P35900 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT20P35900 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT20P35900 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT20P35900 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT20P35900 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT20P35900 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT20P35900 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT20P35900 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT20P35900 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT20P35900 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT20P35900 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT20P35900 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT20P35900 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT20P35900 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT20P35900 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT20P35900 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT20P35900 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT20P35900 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT20P35900 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT20P35900 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT20P35900 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT20P35900 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT20P35900 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT20P35900 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT20P35900 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT20P35900 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT20P35900 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT20P35900 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT20P35900 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT20P35900 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT20P35900 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT20P35900 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT20P35900 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT20P35900 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT20P35900 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT20P35900 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT20P35900 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT20P35900 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT20P35900 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT20P35900 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT20P35900 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT20P35900 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT20P35900 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT20P35900 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT20P35900 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT20P35900 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT20P35900 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT20P35900 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT20P35900 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT20P35900 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT20P35900 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT20P35900 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT20P35900 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT20P35900 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT20P35900 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT20P35900 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT20P35900 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT20P35900 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT20P35900 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT20P35900 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT20P35900 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT20P35900 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT20P35900 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT20P35900 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT20P35900 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT20P35900 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT20P35900 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT20P35900 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT20P35900 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT20P35900 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT20P35900 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT20P35900 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT20P35900 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT20P35900 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT20P35900 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms