Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBSP35520 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBSP35520 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBSP35520 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBSP35520 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBSP35520 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBSP35520 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CBSP35520 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBSP35520 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBSP35520 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBSP35520 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBSP35520 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBSP35520 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBSP35520 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBSP35520 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBSP35520 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBSP35520 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBSP35520 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBSP35520 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBSP35520 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBSP35520 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBSP35520 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CBSP35520 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBSP35520 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBSP35520 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBSP35520 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBSP35520 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBSP35520 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CBSP35520 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBSP35520 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBSP35520 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBSP35520 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBSP35520 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBSP35520 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CBSP35520 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBSP35520 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBSP35520 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBSP35520 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CBSP35520 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBSP35520 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBSP35520 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBSP35520 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBSP35520 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBSP35520 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBSP35520 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBSP35520 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBSP35520 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBSP35520 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBSP35520 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBSP35520 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBSP35520 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CBSP35520 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CBSP35520 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CBSP35520 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBSP35520 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CBSP35520 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBSP35520 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBSP35520 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBSP35520 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBSP35520 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBSP35520 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBSP35520 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBSP35520 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBSP35520 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBSP35520 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBSP35520 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBSP35520 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBSP35520 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBSP35520 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBSP35520 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBSP35520 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBSP35520 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBSP35520 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBSP35520 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBSP35520 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBSP35520 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBSP35520 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBSP35520 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBSP35520 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBSP35520 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBSP35520 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBSP35520 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CBSP35520 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CBSP35520 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBSP35520 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBSP35520 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBSP35520 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CBSP35520 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CBSP35520 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBSP35520 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBSP35520 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBSP35520 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBSP35520 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CBSP35520 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBSP35520 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBSP35520 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBSP35520 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBSP35520 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBSP35520 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBSP35520 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms