Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGS2P35354 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGS2P35354 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGS2P35354 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTGS2P35354 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTGS2P35354 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTGS2P35354 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGS2P35354 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGS2P35354 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGS2P35354 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGS2P35354 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGS2P35354 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGS2P35354 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGS2P35354 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms